Projekty a granty
| Parazitičtí prvoci Blastocrithidia a Trypanosoma jako optimální modely pro testování vzniku a vlastností alternativních genetických kódů | |
|---|---|
| Id projektu | 22-14356S |
| Hlavní řešitel | prof. MSc. Vjačeslav Jurčenko, Ph.D. |
| Období | 1/2022 - 12/2024 |
| Poskytovatel | Standardní projekt GA ČR |
| Stav | řešený |
| Anotace | Genetický kód není absolutně univerzální, neboť se objevuje rostoucí počet jeho variant v mitochondriálních, prokaryotických a eukaryotických genomech. Nejčastěji se změny týkají stop kodónů. Nedávno jsme izolovali a na úrovni morfologie, genomu, transkriptomu a proteomu popsali nového prvoka Blastocrithidia nonstop, v němž všechny tři stop kodóny kódují aminokyseliny. Tato drastická úchylka od standartního kódu je umožněna dosud neznámou změnou tRNA, která patrně vznikla i v řadě dalších eukaryot. Tento projekt si klade za cíl objasnit, jak terminační faktory a struktura tRNA regulují translaci u nestandartních kódů. Blastocrithidia a příbuzná Trypanosoma se standartním kódem představují ideální modely pro analýzu evoluce genetického kódu a odhalení jejích důsledků pro translační mechanismy. Pomocí molekulárních a bioinformatických metod chceme objasnit procesy, které umožňují vznik a fungování neortodoxních nebo nejednoznačných genetických kódů. |
