OU > O univerzitě > Struktura univerzity > Fakulty a ústavy > Přírodovědecká fakulta

Petr Pečinka

Základní

Životopis

Publikační činnost

Výuka

Vedené závěrečné práce

Projekty a granty

titul, jméno, příjmení:	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
místnost, podlaží, budova:	L 204, budova L
funkce:
obor činnosti:
katedra / středisko (fakulta):	Katedra biologie a ekologie (Přírodovědecká fakulta) Environmentální centrum ENC
telefon, mobil:	553 46 2318
e-mail:
osobní WWW stránka:

Vzdělání

1990 – 1993	aspirantura na Biofyzikálním ústavu AV ČR v Brně
1982 – 1987	Přírodovědecká fakulta UJEP (nyní Masarykova univerzita) v Brně – biochemie, Diplomová práce: „Elektrochemické studie metaloproteinů“
1978 – 1982	Gymnázium Bystřice nad Pernštejnem

Kvalifikace

2011	Habilitace docentem molekulkárnbí biologie a genetiky MU
1994	CSc.
1987	RNDr.

Zaměstnání, praxe (včetně postdoktorandských pozic)

2006 – dosud	Ostravská univerzita
1987 – 2006	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Brno

Odborné zaměření

Molekulární biologie a genetika

Členství v profesních organizacích, redakčních radách a poradních orgánech

Genetická společnost Gregora Mendela

Působení v zahraničí

9 – 10/1991	Ústav molekulární genetiky, Moskva, Russia (M. F. Kamenetskii)
3 – 4/1992	Max Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Germany (H. Heumann)
10/1992	Department of Molecular and Cellular Biology, Barcelona, Spain (F. Azorin)
1996 – 1997	Lundberg laboratory, Göteborg, Sweden (M. Kubista), 1 rok

Jazykové znalosti

Angličtina	pokročilý
Ruština	mírně pokročilý

Všechny publikace

Bartas, M., Brázda, V., Karlický, V., Červeň, J. a Pečinka, P. Bioinformatics analyses and in vitro evidence for five and six stacked G-quadruplex forming sequences. BIOCHIMIE. 2018, 150(July), s. 70-75. ISSN 0300-9084.

Bartas, M., Červeň, J., Oppelt, J., Peteja, M., Vávra, P., Zonča, P., Procházka, V., Brázda, V. a Pečinka, P. Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells. Oncology letters. 2018, č. 15, s. 6309-6321. ISSN 1792-1074.

Červeň, J., Mikysková, N., Niziolová, A., Bartas, M., Brázda, V. a Pečinka, P. Preferential binding of p53 and BRCA1 proteins to naturally occurring G-quadruplexes forming sequences. In: The 43rd FEBS Congress Pague. Praha. 2018.

Bartas, M., Mikysková, N., Brázda, V., Karlický, V., Červeň, J., Špunda, V. a Pečinka, P. Six-stacked G-quadruplexes as a preferential target of p53. In: The 43rd FEBS Congress Prague. Praha. 2018.

Brázda, V., Červeň, J., Bartas, M., Mikysková, N., Coufal, J. a Pečinka, P. The Amino Acid Composition of Quadruplex Binding Proteins Reveals a Shared Motif and Predicts New Potential Quadruplex Interactors. Molecules. 2018, 23(9), ISSN 1420-3049.

Bartas, M., Brázda, V., Červeň, J., Karlický, V., Špunda, V. a Pečinka, P. Bioinformatic study of putative five and six stacked G-quadruplexes occurence in Homo sapiens genome. In: Genetic Toxicology and Cancer Prevention 2017 Smolenice. Bratislava: Cancer Research Institude, 2017. s. 62-66. ISBN 978-80-972247-2-1.

Červeň, J., Rybková, Z., Sezimová, H., Pečinka, P. a Malachová, K. Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera. In: The 5th Genetics and Genomics Conference. Nanjing. 2016.

Rybková, Z., Malachová, K., Červeň, J., Sezimová, H. a Pečinka, P. Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera. Journal of Biosciences and Medicines. 2016, č. 4, s. 1-8. ISSN 2327-5081.

Červeň, J., Rybková, Z., Sezimová, H., Malachová, K., Pečinka, P. a Ji, R. Isolation of bacterial and fungal BPA and TBBPA degraders from polluted soils. In: 2nd International conference on environmental pollution and health. Guangzhou. 2016.

Červeň, J., Havran, L., Pečinka, P. a Fojta, M. Electrochemical Activity of Wedelolactone and Probing its Interaction with DNA Using Voltammetry at a Carbon Electrode. ELECTROANAL. 2015, č. 27, s. 2268-2271. ISSN 1040-0397.

Adámik, M., Bažantová, P., Navrátilová, L., Polášková, A., Pečinka, P., Holanová, L., Tichý, V. a Brázdová, M. Impact of cadmium, cobalt and nickel on sequence-specific DNA binding of p63 and p73 in vitro and in cells. BIOCHEM BIOPH RES CO. 2015, č. 456, s. 29-34. ISSN 0006-291X.

Bažantová, P., Červeň, J., Pečinka, P., Adámik, M., Tichý, V. a Brázdová, M. Effect of transition metals on sequencespecific binding of p53 family proteins. s. 459-459.

Červeň, J., Pečinka, P. a Bažantová, P. Electrochemical approach for detection of p53-DNA interactions. s. 123-123.

Pečinka, P., Červeň, J. a Bažantová, P. Kontaminace prostředí a změny na molekulárně genetické úrovni. In: Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí. 1. vyd. ostrava: Ostravská univerzita v Ostravě, 2014. s. 65-85. ISBN 978-80-7464-644-7.

Bažantová, P., Červeň, J., Dolný, A., Drozd, P., Ďuriš, Z., Horká, I., Kalina, J., Karlický, V., Kočárek, P., Kukutschová, J., Malachová, K., Maršálek, R., Materová, Z., Mucha, M., Navrátil, M., Navrátilová, Z., Nezval, J., Novotný, Č., Opálková, M. a Pečinka, P. et al. Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí. 1. vyd. Ostrava: Ostravská univerzita v Ostravě, 2014. 208 s. ISBN 978-80-7464-644-7.

Červeň, J., Pečinka, P., Bažantová, P., Fojta, M., Malachová, K. a Sezimová, H. Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí. In: Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí.

Červeň, J., Pečinka, P., Bažantová, P., Chvátalová, B. a Brázdová, M. EMSA detection of p53 sequence non-specific binding in PCR produced human DNA analogues. J BIOMOL STRUCT DYN. 2013, č. 31, s. 40-40. ISSN 0739-1102.

Pečinka, P., Brázdová, M., Navrátilová, L., Tichý, V., Němcová, K., Lexa, M., Hrstka, R., Adámik, M., Vojtěšek, B., Palaček, E., Deppert, W. a Fojta, M. Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells. PLOS one. 2013, č. 8, s. 1-17. ISSN 1932-6203.

Pečinka, P., Bažantová, P., Červeň, J., Malachová, K. a Brázdová, M. Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo. In: Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo. EMBO, 2012. s. 62-62.

Pečinka, P., Pivoňková, H., Šebest, P., Tichá, O., Němcová, K., Brázdová, M., Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V. a Fojta, M. Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs. BIOCHEM BIOPH RES CO. 2010, č. 393, s. 894-899. ISSN 0006-291X.

Pečinka, P., Pavlíčková, Z. a Červeň, J. Detection of genotoxicity by the means of DNA repair enzymes. In: Environmental changes and biological assessment IV. 1. vyd. University of Ostrava, 2008. s. 17-20. ISBN 978-80-7368-451-8.

Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Paleček, E. a Fojta, M. DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.. BIOCHEM J. 2008, č. 412, s. 57-63. ISSN 0264-6021.

Pavlíčková, Z., Pečinka, P. a Červeň, J. Oxidative damage of DNA induced in plasmid by the reactions with chemical agents. In: Environmental changes and biological assessment IV. 1. vyd. Ostrava: University of Ostrava, 2008. s. 85-89. ISBN 978-80-7368-451-8.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Detection of genotoxicity of environmental contaminants using bacterial mutagenicity tests and by means of plasmid DNA. Faculty of Biology, University of Freiburg. 2007.

Pavlíčková, Z., Červeň, J., Malachová, K. a Pečinka, P. Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA. Chemické zvesti. 2007, roč. 3, s. 217-217. ISSN 1336-7242.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Inovace výběrových cvičení z mikrobiologie. 2007.

Pečinka, P. Laboratorní cvičení z molekulární biologie. 2007.

Malachová, K. a Pečinka, P. Obecná biologie. 2007.

Pivoňková, H., Tichá, O., Fojta, M. a Pečinka, P. Recognition of negatively or positively supercoiled DNA topoisomers by the p53 protein.. FEBS J. 2007, č. 274, s. 153-153. ISSN 1742-464X.

Červeň, J., Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds. In: 59. Zjazd chemikov. Tatranské Matliare. 2007.

Červeň, J., Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds. Chemické zvesti. 2007, roč. 3, s. 136-136. ISSN 1336-7242.

Pečinka, P., Malachová, K. a Pavlíčková, Z. Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě. 2007.

Fojta, M., Brázdilová, P., Cahová, K. a Pečinka, P. A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion.. ELECTROANALSIS. 2006, č. 18, s. 141-151. ISSN 1040-0397.

Pivoňková, H., Pečinka, P., Češková, P. a Fojta, M. DNA modification with cisplatin affects sequence-specific DNA binding of p53 and p73 in the target site-dependent manner. FEBS Journal. 2006, č. 273, s. 4693-4706. ISSN 1742-464X.

Malachová, K., Pečinka, P., Kočárek, P. a Majkus, Z. Nové trendy v biologických oborech. 2006.

Fojta, M., Brázdilová, P., Pečinka, P., Cahová, K. a Fojtová, M. Optimalizace postupů elektrochemické detekce amplifikovaných úseků genomové DNA s využitím molekulární hybridizace. In: Sborník přednášek . s. 23-25.

Pivoňková, H., Pečinka, P., Češková, P. a Fojta, M. Ovlivnění interakce proteinů p53 a p73 s cílovými sekvencemi modifikací DNA cisplatinou. In: Sborník příspěvků . s. 14-14.

Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P. a Paleček, E. Sequence specific DNA binding of p53 can be enhanced by DNA supercoiling. In: Abstracts. s. 270-. ISBN 80-969532-6-5.

Fojtová, M., Brázdilová, P., Pečinka, P., Cahová, K., Havran, L. a Fojta, M. Využití elektrochemických metod při analýze genové exprese. In: Sborník přednášek. s. 26-29.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Zkvalitnění a inovace výuky Cvičení z molekulární biologie. 2006.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P., Pospíšilová, Š., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Male infanticide in captive plains zebra (Equus burchelli).. Animal Behaviour. 2005, roč. 59, s. 689-694.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA-binding ability of P53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies.. FEBS J. 2005, č. 272, s. 302-302. ISSN 1742-464X.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Brázdová, M. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling. ONCOGENE. 2004, č. 23, s. 2119-2127. ISSN 0950-9232.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Brázdová, M. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling.. ONCOGENE. 2004, roč. 23, č. 23, s. 2119-2127. ISSN 0950-9232.

Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercolling. In: Poster Abstracts. s. 95a-.

Jelen, F., Kouřilová, A., Pečinka, P. a Paleček, E. Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry.. BIOELECTROCHEMISTRY. 2004, č. 63, s. 249-252. ISSN 1567-5394.

Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Pospíšilová, Š. a Paleček, E. New ELISA technique for analysis of p53 protein/DNA binding properties. In: Sborník příspěvků. s. 26-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies. In: Mol. Cell. Proteomics, 3 (Suppl.). s. S19-.

Brázda, V., Pospíšilová, Š., Jagelská, E., Pečinka, P., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by protein-kinase C, casein kinase II, cyclin dependent kinase and by monoclonal antibodies. In: Program & Abstracts. s. 130-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Aktivace vazby nádorového supresoru proteinu p53 k cílovým sekvencím superhelikální DNA. In: Program a souhrny sdělení. s. 10-.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P. a Paleček, E. Analysis of p53 protein-DNA binding properties. In: Oral Presentations - Abstracts. s. 5-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Analysis of tumour suppressor p53 protein binding properties by new ELISA technique. In: Mol. Cell. Proteomics, 2. s. 965-.

Fojta, M., Brázda, V., Pivoňková, H., Brázdová, M., Pečinka, P., Paleček, E. a Paleček, J. Binding of tumor suppressor protein p53 to supercoiled and chemically modified DNA. In: Final programme and Abstrakt book. s. PD3/151-.

Jelen, F., Kizek, R., Pečinka, P. a Paleček, E. Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry. In: Book of Abstracts. s. 253-.

Fojta, M., Pivoňková, H., Brázdová, M., Pečinka, P., Brázda, V. a Paleček, E. Rozpoznání struktury DNA nádorově supresorovým proteinem p53. Úloha jeho C-terminální domény. In: Sborník příspěvků. s. 6-7.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P., Pospíšilová, Š., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Analysis of p53 protein-DNA binding properties by new ELISA technique, activation of p53-DNA binding. In: FEBS J.. s. 29-.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of p53 binding to natural binding elements in supercoiled DNAs by monoclonal antibodies. In: Abstracts.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M., Paleček, E. a Fojta, M. Role of tumor suppressor p53 domains in supercoil-selective binding to DNA and p53-DNA filament formation. In: Abstracts.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Fojta, M., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M. a Paleček, E. Role of tumor suppressor p53domains in selective binding to supercoiled DNA.. Nucleic Acids Research. 2002, roč. 30, s. 4966-4974.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M., Paleček, E. a Fojta, M. Role proteinových domén nádorového supresoru p53 při selektivní vazbě na superhelikální DNA a při tvorbě DNA-proteinových filament. In: Sborník příspěvků. s. 21-.

Fojta, M., Brázdová, M., Černocká, H., Pečinka, P., Brázda, V., Paleček, J., Jagelská, E., Vojtěšek, B., Pospíšilová, Š., Subramaniam, V., Jovin, T. M. a Paleček, E. Effects of Oxidation Agents and Metal Ions on Binding of p53 to Supercoiled DNA.. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics . 2000, s. 177-184.

Simonsson, T., Pečinka, P. a Kubista, M. DNA tetraplex formation in the control region of c-myc.. Nucleic Acids Research . 1998, roč. 26, s. 1167-1172.

Pečinka, P. studijní pobyt. 1996.

Paleček, E., Fojta, M., Jelen, F. a Pečinka, P. . Chemical and electrochemical probing of local DNA structures and the role of DNA structures in cancer and genetic diseases. Physics, Chem. and applications of molecular systems Brno. 1995, s. 7-14.

Paleček, E. a Pečinka, P. Chemical Probing of DNA Structure in Cells: Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine.. In: EMBO Practical Course on DNA Probing by Metal Complexes. . s. 40-49.

Pečinka, P., Huertas, D., Azorin, F. a Paleček, E. Intramolecular TAT triplex in (dA)58.(dT)58. Influence of ions.. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics . 1995, roč. 13, s. 29-46.

Paleček, E., Pečinka, P., Vojtíšková, M., Řičicová, J. a Boublíková, P. Probing of DNA structure with osmium tetroxide complexes.. Collection Czech. Chem. Commun.. 1993, roč. 58, s. 227-230.

Paleček, E., Jelen, F., Nejedlý, K., Paleček, J., Pečinka, P., Řičicová, J., Vojtíšková, M. a Zachová, D. Osmium tetroxide complexes: single-strand selective probes of the DNA structure in vitro and in cells.. In: Lilley, D. M. J., Heumann, H., and Suck, D. (eds.), Structural Tools for the Analysis of Protein-Nucleic Acid Complexes. Basel: Birghauser Verlag, 1992. s. 1-22. Series Advances in Life Sciences.

Pečinka, P. výzkumný pobyt. 1992.

Jelen, F., Karlovský, P., Makaturová, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Osmium tetroxide reactivity of DNA bases in nucleotide sequencing and probing of DNA structure.. General Physiology and Biophysics . 1991, roč. 10, s. 461-473.

Paleček, E., Boublíková, P., Jelen, F., Krejčová, A., Makaturová, E., Nejedlý, K., Pečinka, P. a Vojtíšková, M. Chemical proabing of the DNA polymorphic structure in vitro and in situ. . In: In Sarma, M. H., and Sarma, M. H. (eds.), Structure and Methods. Vol. 3. Schenectady: Adenine Press, 1990. s. 237-253.

Karlovský, P., Pečinka, P., Vojtíšková, M., Makaturová, E. a Paleček, E. Protonated triplex DNA in E. coli cells as detected by chemical probing.. FEBS Letters. 1990, roč. 274, s. 39-42.

Studničková, M., Pitřincová, J., Kovář, J., Pečinka, P., Turánek, J. a Fischer, O. Metallotropic forms of zinc, copper and cadmium carbonic-anhydrases and zinc carboxypeptidase reflected in differential pulse polarography. . Bioelectrochemistry and Bioenergetics. 1989, roč. 22, s. 299-311.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Brázdová, M., Paleček, J., Pečinka, P., Karlovská, L., Cherny, D., Billová, S., Vojtěšek, B., Jovin, T. M. a Fojta, M. Binding of p53 protein to supercoiled DNA. In: Book of Abstracts. s. 9-.

Fojta, M., Cahová, K., Brázdilová, P., Pečinka, P., Fojtová, M. a Havran, L. Improved procedures for electrochemical detection of DNA hybridization with PCR-amplified target DNA?s. In: Book of Abstracts. s. Bio21-.

Pivoňková, H., Pečinka, P. a Fojta, M. Influence of cisplatin DNA modification on sequence-specific internations of p53 and p73 with different consensus sequence. .

Fojta, M., Pivoňková, H., Němcová, K., Šebest, P., Pečinka, P., Brázdová-Jagelská, E., Brázdová, M., Brázda, V. a Paleček, E. Interakce proteinu p53 s DNA: Sekvenčně specifická vazba a rozpoznání konformace DNA. In: Sborník příspěvků. s. 8-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies. In: Poster Abstracts. s. 95a-.

Jelen, F., Kouřilová, A., Pečinka, P., Kizek, R., Trnková, L. a Paleček, E. Stripping voltammetry of oligonucleotides. In: Book of Abstracts I.

Zkratka	Název předmětu
1BC1L	Biologie I. - cvičení
1BI1L	Biologie I.
2BC2L	Biologie II.
2BI2L	Biologie II.
BAKAP	Bakalářská práce
BAKPR	Bakalářská práce
BIOIN	Praktický kurz bioinformatiky
BI1LF	Biologie I.
BI2LF	Biologie II.
DIPPR	Diplomová práce
DIPPS	Diplomová práce
DIPRA	Diplomová práce
DIPR1	Příprava diplomové práce 1
DIPR2	Příprava diplomové práce 2
DIPSE	Příprava diplomové práce 2
DIPSS	Příprava diplomové práce 2
DPROT	Proteomika
GENZS	Obecná biologie
MEMOB	Vybrané metody molekulární biologie
MEMOL	Vybrané metody molekulární biologie
MOBIC	Molekulární biologie (praktika)
MOBIP	Molekulární biologie (přednáška)
MOBIS	Molekulární biologie
MOBIU	Molekulární biologie
MOLBI	Molekulární biologie
MOLBS	Molekulární biologie
MOLGE	Základy molekulární biologie a genetiky
OBEBC	Molekulární biologie a genetika - cv.
OBEBI	Obecná biologie
OBEBP	Molekulární biologie a genetika - př.
PBAKP	Příprava bakalářské práce II
PDIPS	Příprava diplomové práce 1
PDIP1	Příprava diplomové práce 1
POMBI	Pokročilé metody v molekulární biologii
PRBP2	Příprava bakalářské práce II
PRS01	Specializační seminář 1
PRS02	Specializační seminář 2
PRS03	Specializační seminář 3
PRS04	Specializační seminář 4
PRS05	Specializační seminář 5
PRS06	Specializační seminář 6
PRS07	Specializační seminář 7
PRS08	Specializační seminář 8
PRS09	Specializační seminář 9
PRS10	Specializační seminář 10
PRS11	Specializační seminář 11
PRS12	Specializační seminář 12
PZBP1	Příprava a zpracování bakalářské práce 1
PZBP2	Příprava a zpracování bakalářské práce 2
PZDP1	Příprava a zpracování diplomové práce 1
PZDP2	Příprava a zpracování diplomové práce 2
QCII1	Článek v index. imp. časopise 1
QCII2	Článek v index. imp. časopise 2
QCII3	Článek v index. imp. časopise 3
QCIN1	Článek v index. neimp. časopise 1
QCIN2	Článek v index. neimp. časopise 2
QCIN3	Článek v index. neimp. časopise 3
QELME	Elektromigrační metody
QMOSY	Molekulární systematika
QMVK1	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 1
QMVK2	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 2
QMVK3	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 3
QNVK1	Akt. účast na národní vědecké konf. 1
QNVK2	Akt. účast na národní vědecké konf. 2
QNVK3	Akt. účast na národní vědecké konf. 3
QSTNK	Struktura nukleových kyselin
QTOGE	Toxikologie a genotoxikologie
QVYC1	Výuková činnost 1
QVYC2	Výuková činnost 2
QZMVP	Zapojení do mezinárodního výzk. projektu
QZNVP	Zapojení do národního výzk. projektu
QZPD2	Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPD	Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPK	Zahraniční studijní pobyt krátkodobý
QZSPS	Zahraniční studijní pobyt střednědobý
STRNK	Struktura a funkce nukleových kyselin
SZMBB	Část SZZ: Molekulární Bi a biochemie
VMMOB	Vybrané metody molekulární biologie
WBINF	Bioinformatics
WMOBU	Molecular cell biology
WPMMB	Advanced course of molecular biology
WVMMB	Selected methods of molecular biology
XGENZ	Základy molekulární biologie a genetiky
XPBAK	Příprava bakalářské práce 2
YMOBI	Molekulární biologie
YOBBI	Obecná biologie
ZGENI	Základy genového inženýrství
6MBL2	Molecular Biology Laboratory II
6MOBU	Molekulární a buněčná biologie
7BAPR	Bakalářská práce
7DIPR	Diplomová práce
7MOBC	Molekulární biologie (cvičení)
7MOBM	Molekulární biologie (cvičení malé)
7MOBP	Molekulární biologie (přednáška)
7MOBU	Molekulární a buněčná biologie
7MOBV	Molekulární biologie (cvičení velké)
7PBP2	Příprava bakalářské práce 2
7PDP1	Příprava diplomové práce 1
7PDP2	Příprava diplomové práce 2
7PMMB	Pokročilé metody v molekulární biologii
7SDP1	Seminář k diplomové práci 1
7SDP2	Seminář k diplomové práci 2
7SEM1	Specializovaný diplomový seminář 1
7SEM2	Specializovaný diplomový seminář 2
7SEM3	Specializovaný diplomový seminář 3
7SEM4	Specializovaný diplomový seminář 4
7SFNK	Struktura a funkce NK
7VMMB	Vybrané metody molekulární biologie
7ZAGI	Základy genového inženýrství
DEMME	Elektromigrační metody
7SDP1	Seminář k diplomové práci 1
7SDP2	Seminář k diplomové práci 2
BI2LF	Biologie II.

Autor	Název práce	Typ	Rok
Bažantová Pavla	Interakce proteinů rodiny p53 s non-B DNA strukturami	disertační	2018
Poláčková Petra	Studium struktury promotoru c-myc genu v lineární a superhelikální DNA.	diplomová
Matějová Aneta	Optimalizace nové high throughput metody pro screening potenciálních G-kvadruplexových sekvencí DNA	diplomová	2019
Niziolová Anna	Termostabilita komplexů BRCA1-DNA.	diplomová	2019
Vanduchová Veronika	Charakterizace vybraných lidských potenciálních G-kvadruplexových lokusů in vitro	diplomová	2019
Kwaśný Ondřej	Vazba proteinu BRCA1 na lokální struktury DNA.	diplomová	2018
Mikysková Nikol	Termostabilita komplexů p53-DNA.	diplomová	2018
Kuchárová Zuzana	Studium interakce proteinu BRCA1 s DNA.	diplomová	2017
Schillerová Sarah	Studium interakce mutantních proteinů p53 s DNA.	diplomová	2017
Wielgusová Kateřina	Vliv iontů na interakce proteinu BRCA1 s DNA.	diplomová	2017
Brož David	Izolace a charakterizace proteinů spojených s apoptózou.	diplomová	2016
Kopečková Monika	Příprava rekombinantních plasmidů pro studium interakcí DNA-protein in vivo	diplomová	2015
Podešvová Lucie	Využití "kroslinkování" k analýze interakcí DNA-protein.	diplomová	2015
Staníčková Zuzana	Interakce proteinu p73 s lineární a superhelikální DNA.	diplomová	2015
Wozniaková Lucie	Vliv sekvencí vytvářejících lokální struktury DNA na replikaci plasmidové DNA.	diplomová	2015
Žihala David	Studium interakcí DNA-protein pomocí "footprintingu"	diplomová	2015
Chvátalová Barbora	Vliv struktury přirozeně se vyskytující sekvence DNA na interakci s proteinem p53.	diplomová	2014
Drozdková Denisa	Využití gelové elektroforézy pro detekci 3´-konců DNA prodloužených terminální deoxynukleotidyltransferázou.	diplomová	2014
Bažantová Pavla	Interakce proteinu p63 s p53CON v lineární a superhelikální DNA.	diplomová	2012
Hodslavská Veronika	Mutační analýza genu pro LDL receptor (LDLR) u pacientů s familiární hypercholesterolémií	diplomová	2012
Klemensová Eva	Detekce poškození DNA pomocí piperidinového štěpení, reparačních enzymů a PCR.	diplomová	2012
Kovácsová Andrea	Vazba nádorového supresoru p53 na tetraplexovou DNA.	diplomová	2012
Moudrá Eva	Detekce poškození DNA účinkem průmyslových barviv.	diplomová	2012
Podzimková Veronika	Studium apoptotických změn ve struktuře DNA pomocí elektroforetických metod.	diplomová	2012
Semer Jan	Použití polymerázové řetězové reakce pro detekci poškození nativní DNA komplexy oxidu osmičelého a diethylpyrokarbonátu.	diplomová	2012
Boháčová Petra	Vliv genotoxických a mutagenních látek na topologický stav plasmidové DNA	diplomová	2011
Hermanová Monika	Detekce lokálních otevřených struktur v přirozených p53-vazebných sekvencích pomocí strukturních sond.	diplomová	2011
Široká Jana	Elektrochemická detekce jednořetězcových úseků získaných pomocí terminální transferázy v kružnicové a lineární DNA.	diplomová	2011
Maršálková Karla	Vliv dvoumocných iontů na sekvenčně-specifickou vazbu proteinu p53 na scDNA	diplomová	2010
Dočkalová Zuzana	Studium rizika genetické eroze při konzervaci genetických zdrojů hrachu setého (Pisum sativum L.) pomocí SSR markerů	diplomová	2009
Červeň Jiří	Detekce mutagenních a potencionálně genotoxických látek pomocí změn topologického stavu plasmidové DNA	diplomová	2008
Guziurová Simona	Proteiny interagující s DNA triplexy	bakalářská	2019
Palej Filip Roderik	Techniky sekvenování DNA	bakalářská	2019
Sluková Zdeňka	Mechanismy opravy dvouřetězcových zlomů.	bakalářská	2018
Matějová Aneta	Vliv proteinu c-myc na vznik nádorů.	bakalářská	2017
Vanduchová Veronika	Vliv proteinu pAPC na vznik nádorů.	bakalářská	2017
Niziolová Anna	Vazba BRCA1 na poškozenou DNA. Interakce s proteiny.	bakalářská	2016
Skýbová Tereza	Utváření epigenetických vzorců během vývoje Drosophila melanogaster.	bakalářská	2016
Ručková Romana	Detekce lokálních struktur DNA in vitro a in vivo.	bakalářská	2015
Wielgusová Kateřina	Vliv nádorového supresoru BRCA1 na opravu poškozené DNA.	bakalářská	2015
Beinhauerová Martina	Struktura a funkce nádorového supresoru BRCA1.	bakalářská	2014
Beinhauerová Monika	Interakce proteinů rodiny 14-3-3 s DNA.	bakalářská	2014
Kuchárová Zuzana	Strukturní změny v regulačních oblastech protoonkogenů a nádorových supresorů.	bakalářská	2014
Kwaśný Ondřej	Interakce proteinu IFI16 s DNA a proteiny.	bakalářská	2014
Schillerová Sarah	Vliv mutací v genu pro p53 na vznik nádorů: změna vazebných preferencí, místa nejčastějších mutací.	bakalářská	2014
Brož David	Analýza interakce proteinu p53 se sekvencemi bez p53CON.	bakalářská	2013
Kopečková Monika	Vazba proteinu p53 s DNA neobsahující p53CON sekvence v lineární a superhelikální DNA.	bakalářská	2013
Kortišová Lucie	Průmyslová barviva a jejich interakce s DNA.	bakalářská	2013
Podešvová Lucie	Strukturní analýza přirozeně se vyskytujících sekvencí interagujících s nádorovým supresorem p53.	bakalářská	2013
Wozniaková Lucie	Vliv látek testovaných v Amesově testu na topologický stav plasmidové DNA.	bakalářská	2013
Žihala David	Chromatinová imunoprecipitace jako nástroj výzkumu interakce proteinu p53 s DNA.	bakalářská	2013
Bahounková Hana	Imunochemické metody při výzkum nádorového supresoru p53.	bakalářská	2012
Chvátalová Barbora	Strukturní analýza p53-vazebné sekvence v superhelikální a lineární DNA.	bakalářská	2012
Feber Kamil	Možnosti využití dvoupovrchových elektrochemických metod k analýze nukleových kyselin.	bakalářská	2012
Holubová Aneta	Sekvenčně-nespecifické interakce proteinu p53 s DNA.	bakalářská	2012
Janečková Ema	Sekvence vytvářející čtyřřetězcové struktury - vlastnosti, výskyt, jejich role v expresi genů.	bakalářská	2012
Königová Adéla	Detekce strukturních změn v promotoru c-myc genu pomocí strukturních sond a polymerázové řetězové reakce.	bakalářská	2011
Zbránková Veronika	Struktura homopurin.homopyrimidinových sekvencí, jejich role při vzniku genetických onemocnění.	bakalářská	2011
Bažantová Pavla	Vazba proteinu p63 na sekvenčně-specifická vazebná místa proteinu p53.	bakalářská	2010
Ondráček Tomáš	Detekce poškození DNA pomocí piperidinu a polymerázové řetězové reakce.	bakalářská	2010
Semer Jan	Optimalizace podmínek polymerázové řetězové reakce pro detekci poškození DNA komplexy oxidu osmičelého a diethylpyrokarbonátu.	bakalářská	2010
Boháčová Petra	Porovnání chování genotoxických látek in vitro a in situ	bakalářská	2009
Hermanová Monika	Strukturní charakteristika přirozeně se vyskytujících vazebných sekvencí nádorového supresoru p53	bakalářská	2009
Klemensová Eva	Detekce poškození DNA pomocí PCR.	bakalářská	2009
Mičková Pavlína	Detekce potencionálně genotoxických látek pomocí změn topologického stavu plasmidové DNA	bakalářská	2009
Moudrá Eva	Detekce mutagenních a potencionálně genotoxických látek pomocí reparačních enzymů	bakalářská	2009
Široká Jana	Detekce poškození DNA pomocí elektrochemických metod.	bakalářská	2009
Urbanová Šárka	Příprava rekombinantních plasmidů obsahujících p53CON místa. Charakterizace interakce proteinu p53 s připravenými plasmidy	bakalářská	2009
Kovácsová Andrea	Alkylace DNA a metody detekce poškození DNA	bakalářská	2008
Maršálková Karla	Vazba nádorového supresoru p53 na lokální otevřené struktury v superhelikální DNA	bakalářská	2008
Šafarčíková Lucie	Sekvenčně-specifická a sekvenčně-nespecifická vazba nádorového supresoru p53 na scDNA	bakalářská	2008
Zumrová Kateřina	Využití elektrochemických metod při detekci poškození DNA	bakalářská	2008
Dočkalová Zuzana	Studium genetické stability na vybraných genotypech hrachu setého (Pisum sativum L.)	bakalářská	2007
Dohnalová Táňa	Inaktivace genu FAD2 desaturázy lnu setého (Linum ussitatisimum L.) pomocí transgenní technologie RNA interference	bakalářská	2007

Využití technik genomiky a transkriptomiky k tvorbě genových zdrojů a výchozích materiálů máku se specifickými vlastnostmi
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2018 - 12/2022
Poskytovatel	Ministerstvo zemědělství
Stav	řešený

Izolace proteinu BRCA1 a charakterizace jeho DNA vazebných vlastností.
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2016 - 12/2016
Poskytovatel	Specifický VŠ výzkum
Stav	ukončený

Strukturně a sekvenčně specifické interakce proteinové rodiny p53 s DNA
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2015 - 12/2015
Poskytovatel	Specifický VŠ výzkum
Stav	ukončený

Vliv iontů těžkých kovů na vazebné schopnosti proteinů rodiny p53
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2015 - 12/2015
Poskytovatel	Katedra biologie a ekologie, Projekty podporované z rozpočtu měst krajských úřadů
Stav	ukončený

Rozvoj moderních trendů v experimentální biologii: význam biomolekulárních interakcí pro funkci buněčných struktur
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	4/2012 - 3/2015
Poskytovatel	OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
Stav	ukončený

Charakterizace vazebných vlastností proteinů rodiny p53 k strukturně a sekvenčně specifické DNA.
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2014 - 12/2014
Poskytovatel	Specifický VŠ výzkum
Stav	ukončený

Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2010 - 12/2012
Poskytovatel	OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
Stav	ukončený

Tvorba předmětu "Pokročilé metody v molekulární biologii" pro studenty navazujícího studia Experimentální biologie
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2011 - 12/2011
Poskytovatel	Fond rozvoje vysokých škol
Stav	ukončený

Interakce standardního a mutantních proteinů p53 s poškozenou DNA a jejich význam při odpovědi buněk na protinádorovou chemoterapii
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2007 - 12/2010
Poskytovatel	Standardní grantový projekt GA AV
Stav	ukončený

Studium molekulárně genetických mechanismů působení genotoxických látek
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	9/2006 - 12/2009
Poskytovatel	Děkanát PřF
Stav	ukončený

Zkvalitnění laboratorních cvičení předmětu Vybrané metody molekulární biologie a zavedení nových praktických úloh
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2009 - 12/2009
Poskytovatel	Fond rozvoje vysokých škol
Stav	ukončený

Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě
Hlavní řešitel	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Období	1/2007 - 12/2007
Poskytovatel	Fond rozvoje vysokých škol
Stav	ukončený