OU > O univerzitě > Struktura univerzity > Fakulty a ústavy > Přírodovědecká fakulta > Součásti fakulty > Katedra biologie a ekologie
Petr Pečinka
| titul, jméno, příjmení: | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| místnost, podlaží, budova: |
M 204, budova M |
| funkce: | |
| obor činnosti: | |
| katedra / středisko (fakulta): |
Katedra biologie a ekologie (Přírodovědecká fakulta) Environmentální centrum ENC |
| telefon, mobil: | 553 46 2318 |
| e-mail: |
Vzdělání
1990 – 1993
aspirantura na Biofyzikálním ústavu AV ČR v Brně
1982 – 1987
Přírodovědecká fakulta UJEP (nyní Masarykova univerzita) v Brně - biochemie, Diplomová práce: "Elektrochemické studie metaloproteinů"
1978 – 1982
Gymnázium Bystřice nad Pernštejnem
Kvalifikace
2011
Habilitace docentem molekulkárnbí biologie a genetiky MU
1994
CSc.
1987
RNDr.
Zaměstnání, praxe
2006 – dosud
Ostravská univerzita
1987 – 2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Brno
Odborné zaměření
Molekulární biologie a genetika
Členství v profesních organizacích, redakčních radách a poradních orgánech
Genetická společnost Gregora Mendela
Působení v zahraničí
1996 – 1997
Lundberg laboratory, Göteborg, Sweden (M. Kubista), 1 rok
10/1992
Department of Molecular and Cellular Biology, Barcelona, Spain (F. Azorin)
3/1992 – 4/1992
Max Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Germany (H. Heumann)
9/1991 – 10/1991
Ústav molekulární genetiky, Moskva, Russia (M. F. Kamenetskii)
Jazykové znalosti
Angličtina
pokročilý
Ruština
mírně pokročilý
Nenalezen žádný záznam.
| Autor | Název práce | Typ | Rok |
|---|---|---|---|
| Bartas Martin | Bioinformatické analýzy nekanonických struktur DNA a jejich interakcí s proteiny | disertační | 2020 |
| Bažantová Pavla | Interakce proteinů rodiny p53 s non-B DNA strukturami | disertační | 2018 |
| Poláčková Petra | Studium struktury promotoru c-myc genu v lineární a superhelikální DNA. | diplomová | |
| Guziurová Simona | Bioinformatická analýza proteinů interagujících s DNA triplexy | diplomová | 2021 |
| Slychko Kristyna | Bioinformatická analýza proteinů interagujících se Z- DNA | diplomová | 2021 |
| Quasnitza Marie | Interakce nádorových supresorů s vybranými promotorovými sekvencemi | diplomová | 2020 |
| Matějová Aneta | Optimalizace nové high throughput metody pro screening potenciálních G-kvadruplexových sekvencí DNA | diplomová | 2019 |
| Niziolová Anna | Termostabilita komplexů BRCA1-DNA. | diplomová | 2019 |
| Vanduchová Veronika | Charakterizace vybraných lidských potenciálních G-kvadruplexových lokusů in vitro | diplomová | 2019 |
| Kwaśný Ondřej | Vazba proteinu BRCA1 na lokální struktury DNA. | diplomová | 2018 |
| Mikysková Nikol | Termostabilita komplexů p53-DNA. | diplomová | 2018 |
| Kuchárová Zuzana | Studium interakce proteinu BRCA1 s DNA. | diplomová | 2017 |
| Schillerová Sarah | Studium interakce mutantních proteinů p53 s DNA. | diplomová | 2017 |
| Wielgusová Kateřina | Vliv iontů na interakce proteinu BRCA1 s DNA. | diplomová | 2017 |
| Brož David | Izolace a charakterizace proteinů spojených s apoptózou. | diplomová | 2016 |
| Kopečková Monika | Příprava rekombinantních plasmidů pro studium interakcí DNA-protein in vivo | diplomová | 2015 |
| Podešvová Lucie | Využití "kroslinkování" k analýze interakcí DNA-protein. | diplomová | 2015 |
| Tulingerová Zuzana | Interakce proteinu p73 s lineární a superhelikální DNA. | diplomová | 2015 |
| Wozniaková Lucie | Vliv sekvencí vytvářejících lokální struktury DNA na replikaci plasmidové DNA. | diplomová | 2015 |
| Žihala David | Studium interakcí DNA-protein pomocí "footprintingu" | diplomová | 2015 |
| Chvátalová Barbora | Vliv struktury přirozeně se vyskytující sekvence DNA na interakci s proteinem p53. | diplomová | 2014 |
| Drozdková Denisa | Využití gelové elektroforézy pro detekci 3´-konců DNA prodloužených terminální deoxynukleotidyltransferázou. | diplomová | 2014 |
| Bažantová Pavla | Interakce proteinu p63 s p53CON v lineární a superhelikální DNA. | diplomová | 2012 |
| Hodslavská Veronika | Mutační analýza genu pro LDL receptor (LDLR) u pacientů s familiární hypercholesterolémií | diplomová | 2012 |
| Klemensová Eva | Detekce poškození DNA pomocí piperidinového štěpení, reparačních enzymů a PCR. | diplomová | 2012 |
| Kovácsová Andrea | Vazba nádorového supresoru p53 na tetraplexovou DNA. | diplomová | 2012 |
| Moudrá Eva | Detekce poškození DNA účinkem průmyslových barviv. | diplomová | 2012 |
| Podzimková Veronika | Studium apoptotických změn ve struktuře DNA pomocí elektroforetických metod. | diplomová | 2012 |
| Semer Jan | Použití polymerázové řetězové reakce pro detekci poškození nativní DNA komplexy oxidu osmičelého a diethylpyrokarbonátu. | diplomová | 2012 |
| Boháčová Petra | Vliv genotoxických a mutagenních látek na topologický stav plasmidové DNA | diplomová | 2011 |
| Hermanová Monika | Detekce lokálních otevřených struktur v přirozených p53-vazebných sekvencích pomocí strukturních sond. | diplomová | 2011 |
| Široká Jana | Elektrochemická detekce jednořetězcových úseků získaných pomocí terminální transferázy v kružnicové a lineární DNA. | diplomová | 2011 |
| Maršálková Karla | Vliv dvoumocných iontů na sekvenčně-specifickou vazbu proteinu p53 na scDNA | diplomová | 2010 |
| Dočkalová Zuzana | Studium rizika genetické eroze při konzervaci genetických zdrojů hrachu setého (Pisum sativum L.) pomocí SSR markerů | diplomová | 2009 |
| Červeň Jiří | Detekce mutagenních a potencionálně genotoxických látek pomocí změn topologického stavu plasmidové DNA | diplomová | 2008 |
| Warmuzová Maxima | G-kvadruplex vazebné proteiny v rostlinách | bakalářská | 2022 |
| Papikova Adela | Metody pro studium přesné lokalizace vazby proteinů a non-B-DNA struktur | bakalářská | 2021 |
| Bajtková Sabina | Chemické látky stabilizující G-kvadruplexy | bakalářská | 2020 |
| Bartošková Alena | Proteiny interagující s levotočivou Z- DNA. | bakalářská | 2020 |
| Marzoll Jiří | Proteiny interagující s G-kvadruplexy DNA | bakalářská | 2020 |
| Guziurová Simona | Proteiny interagující s DNA triplexy | bakalářská | 2019 |
| Palej Filip Roderik | Techniky sekvenování DNA | bakalářská | 2019 |
| Sluková Zdeňka | Mechanismy opravy dvouřetězcových zlomů. | bakalářská | 2018 |
| Matějová Aneta | Vliv proteinu c-myc na vznik nádorů. | bakalářská | 2017 |
| Vanduchová Veronika | Vliv proteinu pAPC na vznik nádorů. | bakalářská | 2017 |
| Niziolová Anna | Vazba BRCA1 na poškozenou DNA. Interakce s proteiny. | bakalářská | 2016 |
| Skýbová Tereza | Utváření epigenetických vzorců během vývoje Drosophila melanogaster. | bakalářská | 2016 |
| Ručková Romana | Detekce lokálních struktur DNA in vitro a in vivo. | bakalářská | 2015 |
| Wielgusová Kateřina | Vliv nádorového supresoru BRCA1 na opravu poškozené DNA. | bakalářská | 2015 |
| Beinhauerová Martina | Struktura a funkce nádorového supresoru BRCA1. | bakalářská | 2014 |
| Beinhauerová Monika | Interakce proteinů rodiny 14-3-3 s DNA. | bakalářská | 2014 |
| Kuchárová Zuzana | Strukturní změny v regulačních oblastech protoonkogenů a nádorových supresorů. | bakalářská | 2014 |
| Kwaśný Ondřej | Interakce proteinu IFI16 s DNA a proteiny. | bakalářská | 2014 |
| Schillerová Sarah | Vliv mutací v genu pro p53 na vznik nádorů: změna vazebných preferencí, místa nejčastějších mutací. | bakalářská | 2014 |
| Brož David | Analýza interakce proteinu p53 se sekvencemi bez p53CON. | bakalářská | 2013 |
| Kopečková Monika | Vazba proteinu p53 s DNA neobsahující p53CON sekvence v lineární a superhelikální DNA. | bakalářská | 2013 |
| Kortišová Lucie | Průmyslová barviva a jejich interakce s DNA. | bakalářská | 2013 |
| Podešvová Lucie | Strukturní analýza přirozeně se vyskytujících sekvencí interagujících s nádorovým supresorem p53. | bakalářská | 2013 |
| Wozniaková Lucie | Vliv látek testovaných v Amesově testu na topologický stav plasmidové DNA. | bakalářská | 2013 |
| Žihala David | Chromatinová imunoprecipitace jako nástroj výzkumu interakce proteinu p53 s DNA. | bakalářská | 2013 |
| Bahounková Hana | Imunochemické metody při výzkum nádorového supresoru p53. | bakalářská | 2012 |
| Chvátalová Barbora | Strukturní analýza p53-vazebné sekvence v superhelikální a lineární DNA. | bakalářská | 2012 |
| Feber Kamil | Možnosti využití dvoupovrchových elektrochemických metod k analýze nukleových kyselin. | bakalářská | 2012 |
| Holubová Aneta | Sekvenčně-nespecifické interakce proteinu p53 s DNA. | bakalářská | 2012 |
| Janečková Ema | Sekvence vytvářející čtyřřetězcové struktury - vlastnosti, výskyt, jejich role v expresi genů. | bakalářská | 2012 |
| Stočesová Adéla | Detekce strukturních změn v promotoru c-myc genu pomocí strukturních sond a polymerázové řetězové reakce. | bakalářská | 2011 |
| Zbránková Veronika | Struktura homopurin.homopyrimidinových sekvencí, jejich role při vzniku genetických onemocnění. | bakalářská | 2011 |
| Bažantová Pavla | Vazba proteinu p63 na sekvenčně-specifická vazebná místa proteinu p53. | bakalářská | 2010 |
| Ondráček Tomáš | Detekce poškození DNA pomocí piperidinu a polymerázové řetězové reakce. | bakalářská | 2010 |
| Semer Jan | Optimalizace podmínek polymerázové řetězové reakce pro detekci poškození DNA komplexy oxidu osmičelého a diethylpyrokarbonátu. | bakalářská | 2010 |
| Boháčová Petra | Porovnání chování genotoxických látek in vitro a in situ | bakalářská | 2009 |
| Hermanová Monika | Strukturní charakteristika přirozeně se vyskytujících vazebných sekvencí nádorového supresoru p53 | bakalářská | 2009 |
| Klemensová Eva | Detekce poškození DNA pomocí PCR. | bakalářská | 2009 |
| Mičková Pavlína | Detekce potencionálně genotoxických látek pomocí změn topologického stavu plasmidové DNA | bakalářská | 2009 |
| Moudrá Eva | Detekce mutagenních a potencionálně genotoxických látek pomocí reparačních enzymů | bakalářská | 2009 |
| Široká Jana | Detekce poškození DNA pomocí elektrochemických metod. | bakalářská | 2009 |
| Urbanová Šárka | Příprava rekombinantních plasmidů obsahujících p53CON místa. Charakterizace interakce proteinu p53 s připravenými plasmidy | bakalářská | 2009 |
| Kovácsová Andrea | Alkylace DNA a metody detekce poškození DNA | bakalářská | 2008 |
| Maršálková Karla | Vazba nádorového supresoru p53 na lokální otevřené struktury v superhelikální DNA | bakalářská | 2008 |
| Šafarčíková Lucie | Sekvenčně-specifická a sekvenčně-nespecifická vazba nádorového supresoru p53 na scDNA | bakalářská | 2008 |
| Zumrová Kateřina | Využití elektrochemických metod při detekci poškození DNA | bakalářská | 2008 |
| Dočkalová Zuzana | Studium genetické stability na vybraných genotypech hrachu setého (Pisum sativum L.) | bakalářská | 2007 |
| Dohnalová Táňa | Inaktivace genu FAD2 desaturázy lnu setého (Linum ussitatisimum L.) pomocí transgenní technologie RNA interference | bakalářská | 2007 |
| Sledování šíření antibioticky rezistentních bakterií a genů v odpadních vodách a recipientu, studium nekanonických forem nukleových kyselin, zkoumání molekulárních změn u Papaver somniferum vystaveného stresovým podmínkám | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2022 - 12/2022 |
| Poskytovatel | Specifický VŠ výzkum |
| Stav | řešený |
| Využití technik genomiky a transkriptomiky k tvorbě genových zdrojů a výchozích materiálů máku se specifickými vlastnostmi | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2018 - 12/2022 |
| Poskytovatel | Ministerstvo zemědělství |
| Stav | řešený |
| Izolace proteinu BRCA1 a charakterizace jeho DNA vazebných vlastností. | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2016 - 12/2016 |
| Poskytovatel | Specifický VŠ výzkum |
| Stav | ukončený |
| Strukturně a sekvenčně specifické interakce proteinové rodiny p53 s DNA | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2015 - 12/2015 |
| Poskytovatel | Specifický VŠ výzkum |
| Stav | ukončený |
| Vliv iontů těžkých kovů na vazebné schopnosti proteinů rodiny p53 | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2015 - 12/2015 |
| Poskytovatel | Katedra biologie a ekologie, Projekty podporované z rozpočtu měst krajských úřadů |
| Stav | ukončený |
| Rozvoj moderních trendů v experimentální biologii: význam biomolekulárních interakcí pro funkci buněčných struktur | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 4/2012 - 3/2015 |
| Poskytovatel | OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost) |
| Stav | ukončený |
| Charakterizace vazebných vlastností proteinů rodiny p53 k strukturně a sekvenčně specifické DNA. | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2014 - 12/2014 |
| Poskytovatel | Specifický VŠ výzkum |
| Stav | ukončený |
| Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2010 - 12/2012 |
| Poskytovatel | OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost) |
| Stav | ukončený |
| Tvorba předmětu "Pokročilé metody v molekulární biologii" pro studenty navazujícího studia Experimentální biologie | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2011 - 12/2011 |
| Poskytovatel | Fond rozvoje vysokých škol |
| Stav | ukončený |
| Interakce standardního a mutantních proteinů p53 s poškozenou DNA a jejich význam při odpovědi buněk na protinádorovou chemoterapii | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2007 - 12/2010 |
| Poskytovatel | Standardní grantový projekt GA AV |
| Stav | ukončený |
| Studium molekulárně genetických mechanismů působení genotoxických látek | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 9/2006 - 12/2009 |
| Poskytovatel | Děkanát PřF |
| Stav | ukončený |
| Zkvalitnění laboratorních cvičení předmětu Vybrané metody molekulární biologie a zavedení nových praktických úloh | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2009 - 12/2009 |
| Poskytovatel | Fond rozvoje vysokých škol |
| Stav | ukončený |
| Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě | |
|---|---|
| Hlavní řešitel | doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc. |
| Období | 1/2007 - 12/2007 |
| Poskytovatel | Fond rozvoje vysokých škol |
| Stav | ukončený |
